Работоспособность всей системы ПРО в огромной степени зависит от надежности управляющих компьютеров. Но хорошо известно, что электронная память не обладает абсолютной надежностью: время от времени в ней возникают непредсказуемые сбои. Как правило, их источником являются быстрые альфа-частицы, испущенные ядром тяжелого атома в результате радиоактивного распада и поражающие основу этой памяти – кремниевые кристаллы. Поскольку радиоактивные ядра в небольших количествах присутствуют почти во всех материалах, с проблемой надежности компьютерной памяти люди столкнулись уже на Земле. В околоземном пространстве вблизи или внутри радиационных поясов фон заряженных частиц значительно выше, чем у поверхности Земли: соответственно уменьшается там и надежность компьютера.
Правда, разработаны специальные математические методы (так называемые корректирующие коды), которые обеспечивают четкую работу памяти, несмотря на сотни возникающих в ней ошибок. Но с тысячами сбоев эти методы уже не справляются. Так, в условиях Земли устройство памяти емкостью 1 Мбайт фиксирует один сбой в среднем за 36 дней, а с использованием корректирующих кодов один неустранимый сбой в нём происходит через 63 года.
Учитывая гигантский объем памяти, требующийся для выполнения задач космической ПРО, а также высокий фон космических лучей, можно заранее быть уверенным в низкой надежности работы компьютеров, в особенности базирующихся на космических аппаратах. Возможны возражения, что, мол, бортовые компьютеры «Вояджеров» успешно работают в космосе уже 48 лет. Однако этот пример нельзя считать убедительным ввиду малого объема памяти бортовых компьютеров упомянутых аппаратов и периодической корректировки её содержимого с Земли.
После того как объект противника обнаружен, идентифицирован, и принято решение о его уничтожении, необходимо прицелиться. Чем лучше сфокусирован луч или пучок оружия направленной энергии, тем сложнее его навести на цель. Для большинства видов космического оружия в качестве прицела придется применять настоящие телескопы с объективами диаметром порядка 1 м.
Не исключено, что при наведении лазерного луча на цель будет использован эффект обращения волнового фронта. Для этого цель необходимо осветить маломощным лазером, а отражённый от неё свет, пройдя оптическую систему мощного боевого лазера, сам запустит поражающий импульс точно в том направлении, откуда он пришел, то есть по направлению к цели. Сейчас такие системы самонаведения создаются для нужд термоядерной энергетики (Зельдович, Шкунов, 1986).