В центре сюжета книги «Диссидент-4: Да не судимы будете» Игоря Черемиса — мужчина, оказавшийся между своим прошлым и настоящим, между службой и личными убеждениями. Главный герой — сотрудник советских органов безопасности, который наблюдает за жизнью и судьбами диссидентов в стране, пытается понять их мотивы и разобраться, кто из них действительно опасен для государства, а кто просто живет по своим принципам. Он встречается с разными людьми — бывшими политзаключенными, писателями, активистами — и размышляет о том, как сложные исторические события и внутренние убеждения формируют их поступки.

Сюжет развивается на фоне последних лет советской эпохи, когда люди устали от репрессий и начали задавать вопросы, которые раньше оставались без ответа. Главный герой совмещает работу с личными переживаниями, порой сомневается в правильности принятых решений и в своем месте в этом мире. Его диалоги с оппонентами и знакомыми показывают, как непросто жить, когда вокруг много недоверия и страха, а выбор кажется слишком узким. В процессе работы он пытается выявить тех, кто может представлять реальную угрозу, и тех, кто просто придерживается иного взгляда на жизнь и историю.

Ключевые мотивы книги — это исследование внутреннего мира человека, оказавшегося в сложных обстоятельствах, поиск смысла и справедливости в мире идей и власти. Рассматривается тема преданности и отречения от себя ради государственной службы, противоборства идеологий и попыток сохранить человечность там, где ее практически не осталось. Вместе с героем читатель задумывается о цене свободы и о том, как люди справляются с давлением системы и собственной совестью.