Отделения (камеры) компании находились: 4 в Амстердаме, 2 в Роттердаме, 2 в Зеландии, по одному в Делфте и Хорне — Энкхёйзене. Квоты этих отделений составляли ½, ¼, ⅛ (объединенный для Делфта и Роттердама) и ⅛ всего капитала Ост-индской компании. Стартовый капитал компании составлял примерно 6,5 млн. флоринов.
Камеры управлялись коллегиями главных акционеров при общей дирекции в составе 8 директоров от Амстердама, 4 от Зеландии и др. (всего 17 директоров).
Акватория Ост-индской компании была обширна и простиралась от южной оконечности Африканского континента (мыс Доброй Надежды) до Магелланова пролива на юге Южно-Американского материка.
По сути, Ост-индская компания была государством в государстве и обладала монопольным правом ведения торговли, мореплавания, беспошлинной транспортировки товара в метрополию, создания факторий, укрепленных прибрежных крепостей, содержания вооруженных сил, включая военные корабли, ведения судопроизводства, право на заключение международных торговых договоров и пр. Действия Ост-индской компании осуществлялись от лица Генеральных штатов провинций Нидерландов.
В 1609–1619 при губернаторе Яне Питерзооне Куне была создана администрация кампании с постоянной резиденцией в Батавии (современная Джакарта в Индонезии).
Используя крупный военный флот, голландцы вытеснили испанцев, португальцев и англичан и основали торговые фактории в Индии, Цейлоне и на территории современной Индонезии.
Нужно отметить, что колонизация проводилась довольно жесткими методами по отношению к туземному населению.
Постепенно акционеры Ост-индской компании становились богатейшими людьми Европы и принимали участие в управлении колоний и политических процессов в самой Голландии и других странах.
Компании удалось не только изменить мир, но и мировой финансовый рынок. До 1602 года купцы финансировали отдельные корабли как товарищества с ограниченной ответственностью, которые прекращали свое существование сразу после возвращения кораблей. Торговцы инвестировали в несколько кораблей одновременно для снижения рисков — если один корабль не вернется, инвестор не будет разорен. Ответственность инвесторов была коллективной — совладельцы делят между собой обязательства, какими бы большими они ни были.
Деньги компания привлекла посредством продажи ценных бумаг — в современной практике данный инструмент называется IPO (Initial Public Offering — первичное публичное привлечение ценных бумаг).
Голландская Ост-Индская компания стала, по сути, первой в истории акционерной компанией, которая предложила инвесторам нести долевую ответственность и, в случае успеха, получение прибыли. Удивительным был факт, что каждый житель Нидерландов мог стать совладельцем компании. Однако для этого необходимо было вложить как минимум 2 400 флоринов (около $300 тысяч) — стоимость одной акции. А это говорило том, что инвесторами могли стать только богатейшие купцы. Всего было выпущено 2153 акции по первоначальной цене 3 000 флоринов.